Nei geni del cane sono stati identificati quattro diversi alleli che determinano la colorazione agouti (una colorazione esemplificabile con quella del coniglio selvatico bruno), nota anche come locus A. Tali alleli sono Ay, aw, at e a. Essi seguono una gerarchia di dominanza; tuttavia, l'espressione fenotipica dipende dalla presenza o meno del gene dominante per il nero al locus K o del gene recessivo al locus E. Se il cane possiede uno o entrambi questi geni, l'azione del locus A viene inibita e la colorazione agouti non si manifesta, poiché sia il locus K che il locus E sono dominanti rispetto al locus A.
Allele "Ay"
L'allele "Ay" è il più dominante tra i quattro alleli del locus A. Il gene Ay produce una gamma di colorazioni del mantello che spazia dal fulvo chiaro al rosso più scuro, fino al "sable" (o zibellino); tale variazione cromatica è dovuta a differenze nell'espressione del gene stesso.
Allele "aw"
L'allele "aw" produce una colorazione nota come "wild sable" (sable selvatico). Questa colorazione è talvolta definita "wild type" (tipo selvatico) o, in alcune razze, "cinghiale" (wild boar). Con questa colorazione, i peli presentano un'alternanza di pigmentazione, passando dal nero a tonalità rossastre o fulve; è una colorazione che si riscontra talvolta nei Pastori Tedeschi e in altre razze da pastore. È recessivo solo rispetto all'allele Ay, il che significa che è dominante sugli alleli at e a, prevalendo su di essi nella manifestazione del fenotipo.
Allele "at"
L'allele "at" è responsabile sia del fenotipo nero-focato (black-and-tan) che di quello tricolore. Un cane tricolore è essenzialmente nero-focato con l'aggiunta del bianco; il bianco rappresenta generalmente un'assenza di colore piuttosto che un pigmento effettivamente prodotto dal cane. Affinché un cane presenti il fenotipo nero-focato o tricolore, deve essere omozigote recessivo (n/n) per il gene dominante del nero al locus K; ciò implica che il locus K non si esprime e il cane non presenterà un mantello nero uniforme. Inoltre, il cane deve possedere due copie dell'allele *at*, oppure una copia dell'allele *at* e una copia dell'allele *a*.
Allele "a"
L'allele "a": se un cane presenta il genotipo *ky/ky* al locus K, deve essere *n/n* per gli alleli *Ay*, *aw* e *at* affinché si manifesti la colorazione *a/a*. Un cane completamente nero con genotipo recessivo al locus K deve possedere anche l'allele recessivo *a/a* per manifestare la colorazione nera.